黑龙江大学自然科学学报

2019, v.36(06) 661-667

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基于Logistic 奇异值分解模型的全基因组关联检测(英文)
Genome-wide association detection based on a Logistic singular value decomposition model

于婷;袁超凤;周影;马维军;

摘要(Abstract):

从海量的单核苷酸多态性(SNPs)中,挑选出与疾病或某些临床、环境因素有关的位点,仍是全基因组关联研究中的一个重要课题。针对表型-SNP数据构成的二维列联表结构,提出了一个Logistic SVD模型。该模型可以同时考虑所有的SNP。另外,通过刻画SNP基因型在不同疾病表型水平下的分布差异,基于该模型构建了一个SNP检测准则。模拟研究显示,所提出的检测准则比现有的检测方法更加有效。

关键词(KeyWords): 生物标记检测;全基因组关联研究;Logistic SVD;SNP

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): Supported by the Natural Science Foundation of Heilongjiang Province(A201207);; the Fundamental Fund for Universities in Heilongjiang Province(KJCX201802)

作者(Author): 于婷;袁超凤;周影;马维军;

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